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上海海洋大学海洋科学学院前身为1912年创建的江苏省立水产学校渔捞科，1952年发展为上海水产学院海洋渔业系，1992年改名为上海水产大学工程技术学院，2000年改名为上海水产大学海洋学院，2008年改名为上海海洋大学海洋科学学院。经过几代人的共同努力，学院已从单一的渔捞科，发展成包括本、硕、博一体化人才培养水产与海洋学科协同发展的高水平特色学院。水产学科入选国家双一流学科，海洋学科入选上海市高原学科。2017年学科评估中，水产学科为A+等级，海洋学科为B-等级。

学院现建有国家远洋渔业工程技术研究中心、大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室、农业部大洋渔业开发重点实验室、中国远洋渔业数据中心、农业部大洋渔业资源与环境科学观测站、上海市深渊科学工程技术研究中心、上海市海洋局河口海洋测绘工程技术研究中心等国家和省部级科研平台，水产科学国家级教学示范中心等教学平台，以及农业部远洋渔业培训中心、渔业船舶验船师培训基地、中国远洋渔业协会鱿钓渔业技术组、金枪鱼渔业技术组、大型拖网技术组、秋刀鱼渔业技术组和过洋性渔业技术组等一批行业培训和技术服务平台；与中国远洋渔业协会合作成立远洋渔业国际履约研究中心；同时与国内外研究机构合作成立中美海洋遥感及渔业信息研究中心、海洋生态系统与环境实验室、海洋渔业遥感与GIS技术实验室、大洋渔业环境信息与渔情预报产业化基地等一批特色科研平台；建有远洋渔业学院、国际海洋研究中心和测绘应用研究中心等校级平台。

学院下设海洋渔业科学与技术和海洋科学与技术2个系，4个本科专业：海洋渔业科学与技术（含海洋渔业技术、海洋渔业资源与管理、远洋渔业三个专业方向）、海洋资源与环境、海洋科学（含物理海洋学一个专业方向）、海洋技术（含海洋信息工程、海洋测绘二个专业方向），其中海洋渔业科学与技术专业被列为国家特色专业，是上海市高校第二和第三期教育高地建设专业；海洋渔业科学与技术教学团队2008年分别获国家和上海市教学团队；远洋渔业国际履约团队2017年获“全国高校黄大年式教师团队”。2013年起海洋科学、海洋技术按海洋科学类专业第一批次招生。

学院具有1个水产学科博士后流动站；2个一级学科博士学位授予点(水产学，海洋科学)； 2个一级学科硕士学位授予点(水产学，海洋科学)；6个二级学科硕士学位授予点(捕捞学、渔业资源学、渔业水域治理与保护、物理海洋学、海洋生物学、海洋地质学)。

近年来，学院教师承担了包括国家863计划、国家科技支撑计划、国家自然科学基金、农业部公海渔业资源探捕专项、上海市科委重大重点等一大批科研项目，年均科研到账经费近4000万元；先后获国家科技进步奖3项、国家教学成果奖2项，省部级科技奖和教学成果奖30多项；学院教师受农业部指派，代表中国出席国际区域渔业管理组织会议，任七个区域性国际渔业管理组织的中方首席科学家。

学院现有教职工120名（截止到2018年1月），其中教授（研究员）17名、副教授（副研究员、高级工程师）31名，博士生导师11人，硕士生导师34人，师资博士后7名。另聘有双聘院士1名，国内外特聘教授23人。其中，拥有中国十大科学之星1人，国家政府津贴5人，第六、七届国务院学位委员会学科评议组成员各1人，长江学者2人，国家杰青1人，新世纪百千万人才工程国家级人选2人，全国优秀科技工作者2人，国家级教学团队负责人1人，教育部新世纪优秀人才1人，农业部杰出人才及创新团队1名，首届中国水产青年科技工作者1人；上海市领军人才1人，上海市优秀学科带头人1人，上海市曙光跟踪计划1人，上海市曙光学者5人，东方学者6人，青年东方学者2人，上海市科委启明星3人，晨光学者2人，上海市教学团队负责人1人，上海市教学名师1人，上海科教系统创新人才2人，浦江人才计划5人，扬帆计划6人。

近百年来，学院为我国海洋渔业、海洋科学与技术的生产、教育、科研和管理部门培养和输送了大批优秀专业人才，许多校友已成为所在部门的领导和科研骨干，特别是为远洋渔业的起步和发展提供了强有力的技术支撑。

未来，学院将秉承“勤朴忠实”校训精神，积极对接国家“海洋强国”战略、“一带一路”倡议，以学校十三五规划和一流学科建设高校建设方案为指导，坚持聚焦、错位和合作的发展原则，以海洋和水产二大特色学科发展，以及一流学科建设为抓手，坚持专业、学位、学科、平台、科研五位一体的发展思路和国际化的合作办学与科学研究发展道路，不忘初心、牢记使命、永远奋斗，为把海洋科学学院建设成国际化、高水平、特色鲜明的研究型学院而奋斗。